SPYGEN : immatriculation, registre du commerce et des sociétés et activités liées à l’ADNe

Créée en 2011, SPYGEN est une « Entreprise à Mission » qui a pour objectif d’améliorer le suivi et la conservation de la biodiversité aquatique et terrestre à l’échelle mondiale, grâce à l’étude de l’ADN environnemental (ADNe). Inscrite (Insee) le 19/01/2011, immatriculée au RNE (INPI) le 21/01/2011, SPYGEN est enregistrée sous le numéro Siren 529 756 108 et immatriculée au Registre du commerce et des sociétés (RCS) de Chambéry.

Forme juridique, siège social et capital

SPYGEN est une société par actions simplifiée (SAS) au capital de 30 000 euros. Son siège social est situé Immeuble Koala - 17, rue Lac Saint André Savoie Technolac 73370 Le Bourget-du-Lac. Le site www.spygen.com a pour objet de fournir des informations concernant l’ensemble des activités de la société SPYGEN qui est spécialisée dans le suivi de la biodiversité aquatique et terrestre grâce à l’ADN environnemental (ADNe).

Activité principale déclarée et évolution

Activité : Produits et prestations de services en biotechnologie spécialisées dans l'utilisation de l'ADN pour l'étude de la diversité biologique ou l'identification d'espèce (animaux, végétaux, micro-organismes) dans le milieu naturel, dans des substrats complexes ou à partir d'échantillons biologiques (fragments de tissus, plantes, etc.).

Depuis 2013 et jusqu'aux dernières déclarations, SPYGEN a régulièrement mis à jour son objet social pour préciser son offre : prestations de services en biotechnologie, spécialisées dans l'utilisation de l'ADN pour l'étude de la diversité biologique ou l'identification d'espèces dans divers milieux (eau douce, milieu marin, sols, substrats complexes).

Administration, dirigeants et mouvements récents

La société a connu plusieurs modifications de son administration au fil des années. Aux termes des délibérations de l’assemblée générale ordinaire en date du 25 octobre 2022, les associés ont décidé de mettre fin avec effet immédiat au mandat de Directeur Général de la société HOLDING EGILOPE. Par la même AGO du 25/10/2022, la société CYMA, SAS au capital de 30 000 €, immatriculée au Registre du commerce et des sociétés sous le numéro 920 192 622, a été nommée en qualité de Présidente en remplacement de M. Tony DEJEAN, démissionnaire.

Historique des nominations et mouvements :

Nomination de HOLDING EGILOPE en qualité de Directeur Général à compter du 01/12/2019 (immatriculation HOLDING EGILOPE 823 035 266 RCS AVIGNON).
Jusqu'en 2022, Président : DEJEAN Tony Clovis ; Directeur général : HOLDING EGILOPE.
Depuis 25/10/2022 : Président : CYMA ; Directeur Général : HOLDING EGILOPE (puis départ de HOLDING EGILOPE effectif également annoncé).

Effectifs et statut administratif

L’effectif salarié déclaré : 20 à 49 salariés en 2023. Toutes les structures référencées sur certains répertoires publics sont inscrites à un ou plusieurs référentiels publics (base Sirene, RNE, RNA). L’Extrait RNE est le justificatif d’immatriculation de l’entreprise. Les données publiques relatives à l’entreprise sont susceptibles d’évolution et proviennent des mises à jour du RCS et de l’Insee.

Technologies, produits et offres commerciales

SPYGEN devient la première entreprise au monde à proposer des services d’analyse de l’ADNe et à réaliser des inventaires de biodiversité basés sur le métabarcoding de l’ADNe. SPYGEN devient l’une des premières entreprises à fournir des services commerciaux pour l’analyse de l’ADNe en milieu marin.

Nous avons développé des méthodes de prélèvement de l’ADNe optimisées pour une grande diversité d’écosystèmes. En milieu aquatique, nos filtres à haute capacité permettent de filtrer 30 litres d’eau ou plus, augmentant ainsi la quantité d’ADNe collectée sur le terrain par rapport aux filtres standards (qui traitent généralement des volumes de filtration de 5 litres en moyenne). Le filtre développé par Spygen avec une entreprise américaine pour capter l'ADN environnemental est contenu dans une capsule. Celle-ci est raccordée à une pompe placée dans l'eau de mer pendant 30 minutes, de quoi retenir les millions de traces ADN contenues dans 30 litres d'eau.

Lancement sur le marché de nos capsules de filtration haute capacité pour la collecte de l’ADNe dans les écosystèmes marins. Nous concevons également des stratégies d’échantillonnage reposant sur une filtration continue le long de transects, offrant une couverture spatiale plus étendue et une probabilité accrue de détection des espèces.

Produits de détection et kits

Lancement du couple d’amorces leader du marché pour la détection des crustacés. Lancement du couple d’amorces leader du marché pour la détection des gastéropodes. New Vertebrate Screening Kit: €290 per kit until 31 October. Découvrez comment le métabarcoding d’ADNe de SPYGEN offre une vision rapide et économiquement avantageuse de la biodiversité, en détectant plus de 70 taxons de vertébrés - y compris des espèces communes, rares, à fort enjeu de conservation et exotiques envahissantes - en seulement une dizaine d’heures de terrain sur un site Natura 2000 de 4 000 hectares (14 mares naturelles et artificielles).

Recherche & Développement, brevets et partenariats

Nos efforts en R&D nous permettent de réaliser les inventaires d’espèces les plus robustes et exhaustifs possibles, en utilisant nos technologies ADNe plusieurs fois brevetées. Après 10 ans à se concentrer sur sa R&D, SPYGEN compte 90 publications scientifiques et 6 brevets. Nous nous engageons dans des Partenariats de Recherche visant à développer des projets innovants dans le monde entier. Nos Partenariats Technologiques sont dédiés au développement d’outils novateurs, tels que des véhicules autonomes de prélèvement d’ADNe capables d’opérer à diverses profondeurs océaniques, y compris en haute mer.

Nous Collaborons avec des Experts pour favoriser l’innovation au service de la connaissance et de la protection des organismes vivants. Un exemple notable est l’Alliance Internationale Vigilife, lancée en 2021. Des analyses alimentent le programme « Aires marines sentinelles » porté par l’observatoire Vigilife et financé notamment par EDF comme mécène.

Exemples d’applications et résultats scientifiques

Une étude récente a exploré des canyons sous-marins profonds, jusqu’alors inexplorés, au large de Banyuls-sur-Mer, en combinant des échantillonnages de surface avec des transects profonds miroir réalisés à l’aide de véhicules sous-marins autonomes (AUV). Les résultats ont mis en évidence une communauté des grandes profondeurs nettement distincte, qui n’aurait pas pu être détectée par un échantillonnage de surface seul. Au total, 13 espèces de chondrichthyens (requins et raies) ont été détectées. Parmi elles, 8 ont été identifiées exclusivement grâce aux transects profonds réalisés par AUV, incluant des espèces menacées et hautement mobiles telles que le renard de mer (Alopias vulpinus).

Discover how SPYGEN’s eDNA metabarcoding provides a rapid, cost-effective overview of biodiversity, detecting more than 70 vertebrate taxa - including common, rare, conservation-priority, and invasive species - with just 10 hours of fieldwork across a 4,000 ha Natura 2000 site (14 natural and artificial ponds). Une enquête rapide par ADN environnemental (ADNe) menée sur le fleuve Corubal, en Guinée-Bissau, a révélé la présence de 125 espèces de vertébrés aquatiques et terrestres, dont 21 nouvelles mentions nationales. Les chercheurs ont détecté 11 espèces menacées, parmi lesquelles le chimpanzé d’Afrique de l’Ouest, en danger critique d’extinction, ainsi que la moule Pleiodon ovatus.

L'ADNe permet de contourner ces contraintes. Résultat : le nombre d'espèces d'Unionida connues en Guyane française passe de 5 à 18. Deux espèces cryptiques détectées par l'ADNe ont été confirmées sur le terrain et décrites formellement comme nouvelles pour la science. Quelques litres d’eau de rivière ont révélé ce que des décennies de prospections de terrain n’avaient pas permis de mettre en évidence : la présence de Zenk erella insignis, l’un des mammifères les plus énigmatiques au monde.

Applications opérationnelles et clients

SPYGEN travaille pour des acteurs variés : institutions scientifiques, programmes de conservation (ex. WWF), aménageurs privés (ex. Compagnie nationale du Rhône), parcs marins (ex. parc marin de la Côte Bleue) et projets internationaux. Spygen, devenu BCorp et entreprise à mission, travaille ainsi pour le WWF dans le cadre de programmes de conservation d’espèces comme le tigre du Bengal.

Les équipes réalisent des prélèvements d’eau de mer dans des zones protégées et en conditions météo difficiles pour capturer des millions de traces ADN dans un filtre, enfermé dans une petite capsule. Pour identifier les espèces auxquelles elles appartiennent, le filtre est ensuite envoyé au laboratoire de la société à Bourget-Le-Lac près d’Annecy. C’est là qu’une petite vingtaine de personnes travaillent à déchiffrer le vivant. Les millions de traces ADN captées - en majorité de micro-organismes - y sont extraits, amplifiés, séquencés et enfin comparés à une « encyclopédie » de référence qui permet d’identifier les espèces.

Impact pour la conservation et l’aménagement

L’ADNe a par exemple permis de détecter la présence de requins anges au large de la Corse en 2021, confirmée sept fois en 2023, alors qu’il n’avait pas été observé par des yeux humains depuis les années 2000. « Cette redécouverte va générer la création de nouvelles aires protégées. L’ADN environnemental a un impact très concret pour mettre en application l’objectif de protection de 30 % des terres et des mers en 2030. Il est un indicateur pour protéger au bon endroit », s’enthousiasme David Mouillot.

Les projets d’aménagement doivent obligatoirement produire une étude d’impact environnementale avec un inventaire de la biodiversité du site, réalisée par des bureaux d’études. « L’ADNe permet d’objectiver les inventaires d’espèces, sans dépendre de la perception humaine et avec une traçabilité et une détectabilité beaucoup plus élevée », estime Benjamin Allegrini, PDG de Spygen. Et avec à la clef, des délais et des coûts d’études divisés par 10, promet l’entrepreneur : « Une campagne d’ADNe sur un fleuve peut être aussi efficace que 10 ans de méthode traditionnelle de pêche électrique ».

Module 3 (Eaux douces et milieux marins) : Dynamique de Comportement et de Détection de l’ADNe

Formation et transfert de compétences

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Propriété intellectuelle, site web et mentions légales

Toutes les informations indiquées sur le site www.spygen.com sont données à titre indicatif et sont susceptibles d’évoluer. Les appellations SPYGEN et VigiDNA, les logos, les noms des produits et services qui y sont associés, sont des marques déposées par SPYGEN. Toute reproduction totale ou partielle du site web www.spygen.com est interdite sans l’autorisation expresse et préalable de SPYGEN.

SPYGEN s’efforce de fournir sur le site www.spygen.com des informations aussi précises que possible. Toutefois, SPYGEN ne pourra être tenue responsable des omissions, des inexactitudes et des carences dans la mise à jour, qu’elles soient de son fait ou du fait des tiers partenaires qui lui fournissent ces informations. La société SPYGEN ne saurait être tenue responsable des temps d’accès à son site Internet en raison des défaillances ou dysfonctionnements du réseau Internet.

Perspectives économiques et positionnement sur le marché

Fort d’une technologie née en France, la PME ne recense qu’un concurrent notable au Royaume-Uni, qui travaille sur des collectes d’ADN plus petites. Après 10 ans à se concentrer sur sa R&D, 90 publications scientifiques et 6 brevets, Spygen prévoit de réaliser 3 millions d’euros de chiffre d’affaires en 2024, et compte bien profiter d’un marché en pleine expansion. Dans le cadre de sa nouvelle stratégie nationale biodiversité, l’État français a affirmé sa volonté de lancer un « inventaire exhaustif » du vivant en France, notamment grâce à l’ADN environnemental. Spygen compte bien se positionner pour répondre à l’appel d’offres.

Élément	Donnée
SIREN	529 756 108
Forme juridique	Société par actions simplifiée (SAS)
Capital	30 000 €
Siège	17, rue Lac Saint André, Immeuble Koala, 73370 Le Bourget-du-Lac
Effectif (2023)	20 à 49 salariés
Brevet / Publications	6 brevets, 90 publications

SPYGEN combine technologie, passion pour le vivant, et une présence internationale, réalisant des inventaires animaliers pour mieux protéger la biodiversité et bénéficiant d’un marché de plus en plus porteur. Les applications vont de la mer profonde aux rivières souterraines, en passant par l’agriculture et la viticulture, et couvrent déjà 80 pays.

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