Crédit d'Impôt Agriculture Biologique : Conditions et Modalités en France

Le crédit d'impôt en faveur de l'agriculture biologique est un dispositif de soutien financier destiné aux entreprises agricoles engagées dans le mode de production biologique. Ce mécanisme vise à encourager et à accompagner les agriculteurs dans leur transition vers des pratiques plus respectueuses de l'environnement.

Si les agriculteurs ont repris la route des manifestations, les producteurs biologiques tirent aussi la sonnette d’alarme. « Les fermes biologiques continuent de rencontrer des difficultés importantes de trésorerie », alerte la Fédération nationale de l’agriculture biologique (FNAB), jeudi 21 novembre 2024.

I. Champ d'Application du Crédit d'Impôt Bio

L'article 244 quater L du code général des impôts (CGI) prévoit un crédit d'impôt en faveur des entreprises agricoles dont 40 % au moins des recettes proviennent d'activités agricoles relevant du mode de production biologique. Ce crédit d'impôt s'applique au titre de chacune des années 2011 à 2025.

A. Entreprises concernées

Le crédit d'impôt prévu à l'article 244 quater L du CGI bénéficie aux entreprises agricoles imposées à l'impôt sur les bénéfices, quels que soient leur mode d'exploitation (entreprise individuelle ou société) et leur régime d'imposition (micro-BA, régime réel simplifié ou réel normal).

B. Nature des recettes à prendre en compte

Les entreprises agricoles bénéficient du crédit d'impôt au titre de l'année au cours de laquelle au moins 40 % de leurs recettes proviennent d'activités agricoles mentionnées à l'article 63 du CGI relevant du mode de production biologique défini par le règlement (UE) n° 2018/848. Le seuil de 40 % de recettes s'apprécie au 31 décembre de chacune des années concernées par le dispositif, quelle que soit la date de clôture des exercices.

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Pour déterminer si l'entreprise respecte le seuil de 40 %, il convient d'établir le rapport entre :

• Le montant des recettes qui proviennent des activités mentionnées à l'article 63 du CGI qui ont fait l'objet d'une certification en agriculture biologique au sens du règlement (UE) 2018/848 ;
• Le montant total des recettes qui proviennent des activités mentionnées à l'article 63 du CGI.

Il est admis que les recettes qui proviennent des activités mentionnées à l’article 63 du CGI qui ont fait l’objet d’une certification « produits en conversion vers l’agriculture biologique » soient prises en compte au numérateur de ce ratio.

Les recettes accessoires qui ne trouvent pas leur origine directement dans la mise en valeur de l’exploitation ne sont pas à prendre en compte pour le calcul de ce ratio, qu’elles soient imposées dans la catégorie des bénéfices agricoles en application de l’article 75 du CGI ou distinctement selon les règles applicables aux bénéfices industriels et commerciaux ou aux bénéfices non commerciaux.

II. Détermination du Crédit d'Impôt

A. Cas général

En application du 1 du II de l'article 244 quater L du CGI, le montant du crédit d’impôt est de 4 500 €.

B. Entreprises bénéficiant d'une aide à la conversion ou au maintien de l'agriculture biologique

Conformément aux dispositions du 2 du II de l'article 244 quater L du CGI, les entreprises qui bénéficient d'une aide à la conversion à l'agriculture biologique ou d'une aide au maintien de l'agriculture biologique en application du règlement (UE) 2021/2115 peuvent bénéficier du crédit d'impôt lorsque le montant résultant de la somme de ces aides et de ce crédit d'impôt n'excède pas 5 000 € au titre de l'année considérée.

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Si le montant total résultant de la somme de ces aides et de ce crédit d’impôt excède 5 000 € au titre de l’année considérée, le montant du crédit d'impôt est alors diminué, à due concurrence de l’excédent, afin que le montant total de ces aides et de ce crédit d’impôt soit ramené à 5 000 €.

C. Groupements agricoles d'exploitation en commun

Pour le calcul du crédit d'impôt des groupements agricoles d'exploitation en commun (GAEC), les montants mentionnés aux II-A § 40 et II-B § 50 sont multipliés par le nombre d'associés, sans que le montant du crédit d'impôt ainsi obtenu puisse excéder quatre fois le crédit d'impôt calculé dans les conditions prévues aux II-A § 40 et II-B § 50 (CGI, art. 244 quater L, II-3).

D. Application de la réglementation européenne relative aux aides de minimis

Le bénéfice du crédit d'impôt en faveur de l'agriculture biologique est subordonné au respect du règlement (UE) n° 1408/2013 de la Commission, du 18 décembre 2013, relatif à l'application des articles 107 et 108 du traité sur le fonctionnement de l'Union européenne aux aides de minimis dans le secteur de l'agriculture ou du règlement (UE) n° 717/2014 de la Commission du 27 juin 2014 concernant l'application des articles 107 et 108 du traité sur le fonctionnement de l'Union européenne aux aides de minimis dans le secteur de la pêche et de l'aquaculture (CGI, art. 244 quater L, IV).

Le paragraphe 2 de l'article 3 du règlement (UE) n° 1408/2013 de la Commission du 18 décembre 2013 précise que le montant total des aides de minimis octroyées par État membre à une entreprise unique dans le secteur de l'agriculture ne peut excéder 20 000 € sur une période de trois exercices fiscaux.

Le paragraphe 2 de l'article 3 du règlement (UE) n° 717/2014 de la Commission du 27 juin 2014 précise que le montant total des aides de minimis octroyées par État membre à une entreprise unique dans le secteur de la pêche et de l'aquaculture ne peut excéder 30 000 € sur une période de trois exercices fiscaux.

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Or, le seuil de 40 % de recettes provenant d'activités agricoles relevant du mode de production biologique que l'entreprise doit respecter pour bénéficier du crédit d'impôt s'apprécie au 31 décembre de chacune des années concernées par le dispositif, quelle que soit la date de clôture de l'exercice.

Pour apprécier les plafonds de minimis de 20 000 € ou de 30 000 € sur trois exercices fiscaux, il convient donc de se placer au 31 décembre de l'année, qui constitue le fait générateur du crédit d'impôt, quelle que soit la date de clôture de l'exercice. Cette date correspond à la date d'octroi de l'aide.

III. Utilisation du Crédit d'Impôt

Conformément à l'article 199 ter K du CGI, le crédit d'impôt est imputé sur l'impôt sur le revenu dû par le contribuable au titre de l'année au cours de laquelle l'entreprise a respecté les conditions prévues à l'article 244 quater L du CGI. Si le montant du crédit d'impôt excède le montant de l'impôt dû au titre de ladite année, l'excédent est restitué.

L'article 220 M du CGI prévoit que lorsque l'exercice de l'entreprise coïncide avec l'année civile, le crédit d'impôt est imputé sur l'impôt sur les sociétés dû par l'entreprise au titre de l'exercice au cours duquel elle a respecté les conditions prévues à l'article 244 quater L du CGI. En cas de clôture d'exercice en cours d'année, le crédit d'impôt est imputé sur l'impôt sur les sociétés dû au titre de l'exercice clos au cours de l'année suivant celle au cours de laquelle l'entreprise a respecté les conditions prévues à l'article 244 quater L du CGI.

Si le montant du crédit d'impôt excède le montant de l'impôt dû au titre dudit exercice, l'excédent est restitué.

Le crédit d'impôt calculé par les sociétés de personnes mentionnées à l'article 8 du CGI et à l'article 238 bis L du CGI ou les groupements mentionnés à l'article 238 ter du CGI, à l'article 239 quater du CGI, à l'article 239 quater B du CGI, à l'article 239 quater C du CGI et à l'article 239 quinquies du CGI, qui ne sont pas soumis à l'impôt sur les sociétés, peut être utilisé par leurs associés proportionnellement à leurs droits dans ces sociétés ou ces groupements, à condition qu'il s'agisse de redevables de l'impôt sur les sociétés ou de personnes physiques participant à l'exploitation au sens du 1° bis du I de l'article 156 du CGI (CGI, art. 244 quater L, III).

Conformément à l'article 49 septies ZB de l'annexe III au CGI, le crédit d'impôt en faveur de l'agriculture biologique est imputé sur l'impôt dû après les prélèvements non libératoires et les autres crédits d'impôt. L'excédent de crédit d'impôt non imputé est restitué.

IV. Obligations Déclaratives

Les obligations déclaratives liées au crédit d'impôt en faveur de l'agriculture biologique sont précisées à l'article 49 septies ZB bis de l'annexe III au CGI. Les entreprises concernées doivent souscrire une déclaration spéciale n° 2079-BIO-SD (CERFA n° 12657), disponible en ligne sur www.impots.gouv.fr.

A. Personnes morales passibles de l'impôt sur les sociétés

Les personnes morales passibles de l'impôt sur les sociétés doivent déposer cette déclaration spéciale auprès du comptable de la direction générale des finances publiques avec le relevé de solde n° 2572-SD (CERFA n° 12404) mentionné à l'article 360 de l'annexe III au CGI. S'agissant des sociétés relevant du régime des groupes de sociétés prévu à l'article 223 A et suivants du CGI, la société mère dépose les déclarations spéciales pour le compte des sociétés du groupe. Elle les joint, y compris celle la concernant, au relevé de solde relatif au résultat d'ensemble du groupe.

B. Sociétés de personnes et groupements assimilés

1. Sociétés ou groupements

Pour les sociétés de personnes et les groupements assimilés, dont les groupements agricoles d'exploitation en commun, qui ne seraient pas tenus au dépôt de la déclaration annuelle de résultat prévue à l'article 53 A du CGI, la déclaration spéciale mentionnée au premier alinéa est adressée au service des impôts des entreprises dont relève la société de personnes ou le groupement assimilé dans le même délai que la déclaration de revenus des associés lorsque ceux-ci sont des personnes physiques ou que la déclaration annuelle de résultat lorsque les associés sont des personnes morales tenues de déposer cette déclaration en application de l'article 53 A du CGI.

2. Associés personnes physiques des sociétés de personnes et des groupements assimilés

Les associés personnes physiques joignent à leur déclaration de revenus la déclaration spéciale indiquant les quotes-parts de crédit d'impôt issues de leur participation dans les groupements susvisés.

3. Associés personnes morales des sociétés de personnes et des groupements assimilés

Les associés personnes morales joignent la déclaration spéciale à leur déclaration annuelle de résultat lorsqu'elles sont tenues de la déposer en application de l'article 53 A du CGI.

V. Les revendications de la FNAB

L’organisme réclame une hausse du crédit d’impôt bio à 6 000 euros par an et son prolongement jusqu’à 2028. Actuellement, le crédit d’impôt pour l’agriculture biologique est de 4 500 euros par an, et devrait s’arrêter après l’année 2025. Concernant la moitié des fermes en bio, le crédit d’impôt est « un outil efficace et juste pour soutenir les fermes biologiques », contrairement à des aides ponctuelles, affirme l’organisme.

Pour financer cette hausse, la FNAB appelle à utiliser l’argent non dépensé de la conversion en biologique. Selon cette dernière, sur l’année 2023, seulement 20 % du budget prévisionnel conversion a été dépensé. « On ne peut pas avoir d’un côté des fermes bio en crise et de l’autre des enveloppes financières qui vont dormir sur des étagères ministérielles », explique Philippe Camburet, président de la FNAB.

Alors que l’examen du PLF commence lundi 25 novembre au palais du Luxembourg, la FNAB propose que les sénateurs « soutiennent une hausse du crédit d’impôt bio à 6 000 euros par an ».

Interrogée par la France agricole, la ministre de l'Agriculture Annie Genevard n'écarte pas la reprise de cette mesure : « Je sais qu’il y a des demandes sur la restauration d’un certain nombre de budgets, comme le plan protéines, les bio, les haies… Il y a une grande diversité d’amendements mais je suis attentive à tenir mon budget avec les contraintes budgétaires que l’on connaît, à ne pas sacrifier l’essentiel et à laisser des marges de manœuvre pour pouvoir répondre aux urgences qui viendraient à se présenter ».

Tableau récapitulatif des montants du crédit d'impôt bio :

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